单位补缴社保的撤销操作主要取决于补缴申请的状态：
如果单位仅仅是申请了社保补缴，但还没有进行确认，那么可以通过网上操作撤销该申请。具体操作步骤包括登录社保网站，输入企业用户名和密码，选择“申报”项下的“取消申报”即可。
一旦社保缴费申报成功并在社保局未审批前，数据已经生成，此时无法直接撤销。单位只能按照已有的申报信息进行缴费。
如果在劳动仲裁过程中提出了要求公司补缴社保的申请，该申请可以在仲裁裁决作出前撤销。具体操作可能需要向劳动仲裁委员会提出申请，并由仲裁委员会决定是否撤销。
建议
尽早操作：如果单位发现补缴申请有误或需要撤销，应尽早进行操作，避免数据生成后无法撤销的情况。
咨询专业人士：在撤销申请前，建议咨询专业的法律或社保机构，确保操作符合相关法规要求。
以上信息基于当前的法律和操作流程，具体情况可能因地区和政策的不同而有所差异。