①溃疡病：主要表现是果面有近圆形的病斑凸起，病果不耐储，品相差。由于是一种细菌性病害，所以提升树势、减少伤口以及高湿天气的药剂预防比较关键，有效药剂以铜制剂、抗生素类药物为主，如氢氧化铜、噻菌铜、乙蒜素、中生霉素等。
②炭疽病：初期为水渍状病斑，随后会向内凹陷、破裂，幼果期感病易早落(注：图1还伴有褐腐病，由于该病病斑不会凹陷，固本文不作收录)。这里要特别提醒炭疽病是具有潜伏性的，前期叶片感过病的要格外注意，有效药剂有咪鲜胺、苯醚甲环唑、吡唑醚菌酯等。
③木质化病毒病：百香果病毒病种类较多，其中又以木质化病毒对果品的危害最大。病果通常小而畸形(如图)，若幼果期就表现出病症，果实几乎无法发育。如果遇上此病，基本救治无望，建议拔除。
①果实蝇：雌虫在果面产卵，产卵部位有伤凸起，后期会发黄、腐烂、脱落。此虫防治的关键在于诱杀，可通过悬挂黄色的全逮实蝇诱捕球来进行防治。
②蓟马：挫伤果面，初期呈现银白色不规则疤痕、略凹陷，待果实长大后，渐变为褐色疤痕，对外观品质影响较大。花前就要着手防治，有效药剂有吡虫啉、噻虫嗪、啶虫脒等，注意轮换用药。
生理问题
皱果、缩果：前期的缩果一般是中微量元素如硼缺乏所致，而快速膨大期的皱果则是水分供给出了问题，茎基腐病也可造成此症，区别是后者茎部溃烂，整株枯萎。预防方法主要是做好肥水供给。
此外，前期的机械损伤果亦可能造成后期果面凹凸不平。后要强调的是，果实出现损伤后多是难以复原的，所以预防才是关键！