农村申请自建房的流程如下：
以户为单位向所在村民小组提出宅基地和建房（规划许可）书面申请。
提交相关材料，如户口簿、身份证等，说明建房理由、拟用地位置、面积等信息。
村民小组收到申请后，召开会议讨论，并将申请理由、拟用地位置和面积、拟建房层高和面积等情况在本小组范围内公示。
公示无异议或异议不成立的，村民小组在申请表上签署意见，组长签字、村民小组盖章后，将相关材料交村级集体经济组织或村民委员会审查。
村级组织重点审查提交的材料是否真实有效、拟用地建房是否符合村庄规划、是否征求了用地建房相邻权利人意见等。
审查通过后，由村级组织在申请书上签署意见，村级组织负责人签字、村委会盖章后，报乡镇政府。
乡镇政府收到申请材料后，组织内设的农业农村、自然资源等部门进行联审联办。
自然资源部门审查用地建房是否符合国土空间规划、用途管制要求，涉及占用农用地的，需办理农用地转用审批手续后，核发乡村建设规划许可证；农业农村部门负责审查申请人是否符合申请条件、拟用地是否符合宅基地合理布局要求和面积标准、宅基地和建房申请是否经过村组审核公示等，并综合各部门意见提出审批建议。
乡镇政府根据联审结果进行审批，出具《农村宅基地批准书》，条件具备的地方，可由乡镇直接发放《乡村建设规划许可证》。
在得到乡镇规划办公室的同意后，农民需要前往乡镇规划办公室领取房屋建设申请表，并按要求填写，包括房屋的规模、建筑高度等。
填写好以后提交到村委会进行审查，经村委会审查同意后，再提交到乡镇规划办公室进行最终审批。
乡镇政府审批后，将审批情况报县级农业农村和自然资源等部门进行备案。
经批准用地建房的农户，在开工前向乡镇政府申请划定的宅基地用地范围，并由乡镇政府与相关部门到现场进行开工查验。
住房完工后，由乡镇政府组织相关部门进行验收，查验农户是否按照批准面积、申请要求使用宅基地，并出具《农村宅基地和建房规划许可验收意见表》。通过验收后，农户可以向不动产登记部门申请办理不动产登记。
建议：
申请过程中，确保所有材料的真实性和完整性，严格按照流程操作。
与当地相关部门保持沟通，及时解决申请过程中遇到的问题。
留意申请时限，确保在规定时间内完成所有步骤。