航空限制的责任主要由以下机构负责：
负责全国范围内的民用航空管制工作，是航空限制的总负责单位。
负责各自辖区内的民用航空管制工作，是航空限制的地区负责单位。
负责超出民用航空空域的航空管制。
总结：
民航局调度室和全国范围内的民用航空管制工作由民航局调度室负责。
各地区内的民用航空管制工作由民航地区管理局调度室负责。
超出民用航空空域的航空管制由中国人民解放军空军负责。
