法院扣车的原因主要可以归纳为以下几点：
在交通事故中，法院有权扣车以收集证据和进行核查。交通警察在勘验和检查事故现场时，如果需要，可以扣留事故车辆以备后续核查使用。
在涉及经济债务纠纷等案件中，为防止当事人转移或隐匿财产，法院可以采取财产保全措施，包括查封和扣押车辆。
在案件作出判决后，如果被执行人未履行判决义务，法院可以依法对其占有的动产进行扣押，作为强制执行的一部分。
在发生交通事故后，如果车辆有逃逸行为，交警部门有权暂时查封车辆，直到事故得到妥善处理。
对于犯罪分子犯罪所用或赃款购得的车辆，公安局会将其查封，并禁止审验、过户等一切业务。
车辆手续不全，如未交强险、未年审、证件不符，或驾驶人涉嫌酒驾、服用药物等，法院可以扣车。
根据《最高人民法院关于人民法院民事执行中查封、扣押、冻结财产的规定》，法院可以查封、扣押被执行人占有的动产，包括车辆。
综上所述，法院扣车主要是为了收集证据、保护涉案财产安全、防止不当处置，以及在执行判决过程中采取的必要措施。在具体案件中，扣车的原因可能因案情而异，但均需遵循相关法律规定。