深圳违章申诉的回复时间主要依据《中华人民共和国行政复议法》第三十一条的规定，即行政复议机关应当自受理申请之日起 六十日内作出行政复议决定，但法律规定的行政复议期限少于六十日的除外。若情况复杂，不能在规定期限内作出决定的，经行政复议机关的负责人批准，可以适当延长，并告知申请人和被申请人，但延长期限最多不超过三十日。
因此，深圳违章申诉的回复时间一般为 六十日内，若情况复杂，则可能延长至九十日左右。申诉成功后，交警部门会撤销违章处罚并返还罚款。如果对申诉结果不满意，还可以向当地人民法院提起诉讼。
建议您在申诉时准备好相关证据和材料，并按照规定的流程进行申请，以确保申诉过程顺畅并尽快得到回复。