并案侦查后，将依照下列步骤进行：
侦查机关在并案侦查后，将收集和调取所有与案件相关的证据材料，包括有罪或无罪的证据、罪轻或罪重的证据。
侦查机关会对现行犯或重大嫌疑分子进行拘留，并在拘留后的24小时内进行讯问。犯罪嫌疑人有权聘请律师提供法律咨询和代理申诉、控告。
侦查结束后，侦查机关将案件移送同级人民检察院进行审查起诉。移送时，需一并提交起诉意见书、案卷材料、证据等。
人民检察院在审查案件时，会讯问犯罪嫌疑人，听取被害人和犯罪嫌疑人、被害人委托的人的意见。
人民检察院在审查后，若认为犯罪事实清楚、证据确实充分，将向人民法院提起公诉。
人民法院在受理案件后，将对案件进行审查，若起诉书中有明确的指控犯罪事实和证据，将决定开庭审判。法院一般不会分别开庭，而是将案件合并审理。
若并案处理后证据不足，侦查机关需进一步补充调查取证，包括重新收集、调取相关证据，如询问证人、勘验现场、鉴定等。
若现有证据无法达到证明标准，可考虑对部分案件暂作存疑处理，待有新证据时再行处理。同时，需审查已有证据是否存在瑕疵或可补正之处，并及时补正。
立案后，侦查机关将展开侦查活动，取得犯罪证据后提请批捕犯罪嫌疑人。根据《刑事诉讼法》第八十三条规定，公安机关或人民检察院发现犯罪事实或犯罪嫌疑人，应按管辖范围立案侦查。
通过以上步骤，并案侦查后的案件将经过侦查、移送检察院审查起诉、法院审理等阶段，最终由法院作出判决。在整个过程中，应严格遵循法律程序和证据规则，确保司法公正。